При создании ООО руководитель организации назначается решением учредителя (протоколом общего собрания учредителей). В дальнейшем учредители могут сменить руководителя, приняв соответствующее решение. Решение 2 и более учредителей оформляется протоколом общего собрания. О назначении нового руководителя необходимо уведомить регистрирующий орган. С инструкцией по регистрации вы можете ознакомиться в статье по ссылке.